Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc10P31257 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc10P31257 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms