Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccnd3P30282 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd3P30282 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms