Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms