Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lef1P27782 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lef1P27782 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lef1P27782 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lef1P27782 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms