Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde6aP27664 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6aP27664 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6aP27664 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms