Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CftrP26361 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CftrP26361 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CftrP26361 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CftrP26361 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CftrP26361 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CftrP26361 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CftrP26361 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CftrP26361 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CftrP26361 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CftrP26361 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CftrP26361 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CftrP26361 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CftrP26361 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CftrP26361 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CftrP26361 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CftrP26361 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CftrP26361 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CftrP26361 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CftrP26361 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CftrP26361 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CftrP26361 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CftrP26361 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CftrP26361 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CftrP26361 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CftrP26361 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CftrP26361 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CftrP26361 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CftrP26361 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CftrP26361 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CftrP26361 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CftrP26361 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CftrP26361 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
CftrP26361 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CftrP26361 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CftrP26361 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CftrP26361 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CftrP26361 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CftrP26361 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CftrP26361 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CftrP26361 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CftrP26361 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CftrP26361 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms