Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra2P26048 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gabra2P26048 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra2P26048 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms