Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfyaP23708 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfyaP23708 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfyaP23708 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms