Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms