Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp1P11438 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp1P11438 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms