Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolP11369 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolP11369 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolP11369 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolP11369 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolP11369 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PolP11369 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PolP11369 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PolP11369 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PolP11369 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PolP11369 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PolP11369 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PolP11369 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolP11369 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolP11369 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolP11369 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolP11369 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolP11369 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PolP11369 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolP11369 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolP11369 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PolP11369 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PolP11369 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms