Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nid1P10493 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nid1P10493 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nid1P10493 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms