Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6c1P0CW02 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms