Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UbbP0CG49 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms