Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc9P09633 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc9P09633 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms