Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc8P09025 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc8P09025 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms