Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxa1P09022 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms