Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtkP08923 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtkP08923 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtkP08923 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LtkP08923 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LtkP08923 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LtkP08923 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LtkP08923 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LtkP08923 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LtkP08923 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LtkP08923 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LtkP08923 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LtkP08923 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtkP08923 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LtkP08923 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtkP08923 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtkP08923 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtkP08923 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtkP08923 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtkP08923 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LtkP08923 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LtkP08923 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtkP08923 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtkP08923 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtkP08923 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LtkP08923 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LtkP08923 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LtkP08923 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtkP08923 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtkP08923 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtkP08923 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LtkP08923 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms