Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Apoa4P06728 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apoa4P06728 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apoa4P06728 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms