Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06335 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06335 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06335 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06335 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06335 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06335 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms