Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcrg-V1P06325 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcrg-V1P06325 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms