Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06323 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06323 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06323 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06323 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06323 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P06323 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P06323 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06323 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06323 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06323 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06323 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P06323 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06323 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms