Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Saa1P05366 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa1P05366 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms