Protein–RNA interactions for Protein: P04943

Ig kappa chain V-VI region NQ6-8.3.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04943 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P04943 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P04943 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P04943 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P04943 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04943 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04943 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04943 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04943 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04943 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04943 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04943 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms