Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P04224 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P04224 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P04224 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P04224 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P04224 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P04224 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P04224 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P04224 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms