Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P04213 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P04213 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P04213 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P04213 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P04213 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P04213 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P04213 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04213 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04213 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04213 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04213 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P04213 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P04213 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P04213 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms