Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CfdP03953 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CfdP03953 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CfdP03953 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CfdP03953 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CfdP03953 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CfdP03953 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CfdP03953 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CfdP03953 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CfdP03953 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CfdP03953 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CfdP03953 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms