Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lamb1P02469 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lamb1P02469 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lamb1P02469 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms