Protein–RNA interactions for Protein: P01904

H2-Ea, H-2 class II histocompatibility antigen, E-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-EaP01904 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-EaP01904 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-EaP01904 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms