Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01853 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01853 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01853 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
P01853 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01853 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01853 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01853 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01853 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01853 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01853 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01853 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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