Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01748 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01748 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01748 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P01748 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01748 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01748 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01748 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01748 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01748 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01748 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01748 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01748 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01748 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01748 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms