Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01724 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01724 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01724 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01724 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01724 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01724 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01724 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01724 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01724 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01724 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01724 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01724 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01724 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms