Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PomcP01193 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PomcP01193 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PomcP01193 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PomcP01193 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PomcP01193 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PomcP01193 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PomcP01193 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PomcP01193 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PomcP01193 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PomcP01193 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms