Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtatp6P00848 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtatp6P00848 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms