Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde4aO89084 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde4aO89084 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms