Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vti1bO88384 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vti1bO88384 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms