Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnnt1O88346 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnnt1O88346 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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