Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sigmar1O55242 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms