Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp10O55123 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp10O55123 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms