Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrxO55103 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrxO55103 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrxO55103 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrxO55103 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrxO55103 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrxO55103 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrxO55103 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrxO55103 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrxO55103 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrxO55103 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrxO55103 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrxO55103 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrxO55103 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PrxO55103 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PrxO55103 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrxO55103 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrxO55103 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PrxO55103 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PrxO55103 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PrxO55103 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrxO55103 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrxO55103 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrxO55103 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrxO55103 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrxO55103 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrxO55103 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrxO55103 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrxO55103 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms