Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SncaO55042 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncaO55042 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncaO55042 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaO55042 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaO55042 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaO55042 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncaO55042 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaO55042 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaO55042 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaO55042 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaO55042 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaO55042 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SncaO55042 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncaO55042 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncaO55042 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SncaO55042 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms