Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1bO55017 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1bO55017 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms