Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kpna6O35345 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kpna6O35345 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms