Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ebi3O35228 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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