Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn4O35054 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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