Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casq1O09165 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casq1O09165 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casq1O09165 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casq1O09165 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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