Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gata2O09100 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gata2O09100 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gata2O09100 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gata2O09100 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms