Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp955bL7N232 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp955bL7N232 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp955bL7N232 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp955bL7N232 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp955bL7N232 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp955bL7N232 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms