Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IfnabL7MTU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms