Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8720K9J7F4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8720K9J7F4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms